En los Pirineos hay una gran variedad de ecosistemas, desde bosque a paradera de montaña, en los que viven un gran número de especies de animales y plantas.
Entre las plantas de los Pirineos destacan los árboles como el pino negro, el haya, el roble, el quejigo, la encina y el abeto, que forman grandes bosques. En las zonas más altas hay praderas en las que crecen hierbas como el narciso, la genciana y el edelweiss.
Entre los animales destacan el quebrantahuesos, el águila real, la cabra pirenaica, el rebeco y el
armiño.
En los Pirineos hay una gran cantidad de espacios naturales protegidos. De ellos, los más importantes son el Parque Nacional de Ordesa y el Monte Perdido, en Huesca, y el Parque Nacional de Aigües Tortes y el Lago San Mauricio, en Lérida. En Navarra, un espacio natural de gran importancia es el Parque Natural del Señorío de Bérteiz.
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